Criada em maio de 2009 com recursos do Programa de Fortalecimento e Crescimento da Embrapa, o PAC Embrapa, esta  é uma das novas unidades descentralizadas da Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária, vinculada ao Ministério da Agricultura, Pecuária e Abastecimento.

A Embrapa Agrossilvipastoril (localizada na MT-222 Km 2,5) conta com uma moderna infraestrutura. Em oito mil e quinhentos metros quadrados de área construída, tem 24 laboratórios, salas de pesquisadores e equipe de apoio à pesquisa, biblioteca digital, auditório com capacidade para 120 pessoas, restaurante, centro de treinamento e setor de serviços, compreendendo galpões de máquinas e serviços, garagem, depósitos, abrigo de geração de energia, estação de tratamento de resíduos, central de abastecimento de combustível e casas de vegetação.

Nos laboratórios, modernos equipamentos darão suporte à geração de tecnologias importantes para a região, como indicadores de sustentabilidade da produção agrícola, dinâmica de carbono em solos tropicais, mudanças do clima, dinâmica de água em agroecossistemas, além de contemplar as áreas de sanidade animal e vegetal, fruticultura, produção de sementes e mudas de espécies florestais e frutíferas, entre outros.

Para o desenvolvimento das pesquisas, a Unidade tem uma área experimental de 580 hectares, na qual já foram instalados grandes experimentos, que serão estudados de maneira integrada e multidisciplinar.

A Embrapa Agrossilvipastoril também terá um importante papel para o Mato Grosso com a capacitação de agentes da assistência técnica, públicos e privados. Por meio de capacitações continuadas, espera-se dar suporte a uma assistência técnica de boa qualidade e proporcionar benefícios a todos os segmentos de agricultores presentes no estado, contemplando as cadeias produtivas de maior importância, como grãos, fruticultura, olericultura, leite, piscicultura, mandiocultura, apicultura e sistemas agroflorestais.

Para auxiliar nesta tarefa, a Unidade já conta com um Sítio Tecnológico instalado em uma área de 14 hectares, na qual são apresentadas as tecnologias desenvolvidas pela Embrapa com potencial de uso na região.

Todo o trabalho desenvolvido pela Unidade será realizado por meio de parcerias com o Ministério da Agricultura, Pecuária e Abastecimento, governo do estado, prefeituras e entidades ligadas à produção agropecuária.

A Embrapa Agrossilvipastoril contará com uma equipe de 35 pesquisadores, a maioria deles com o título de doutor, e ainda abrigará outros 35 pesquisadores oriundos de outras Unidades da empresa. Adicionalmente, cerca 70 empregados estarão presentes na sede, desenvolvendo atividades nas áreas administrativa, de transferência de tecnologia, comunicação e de apoio no campo.

Hoje, a Unidade já conta com 97 empregados, sendo 41 deles pesquisadores.

Para que toda esta estrutura fosse erguida, foram gastos cerca de R$ 30 milhões entre a construção da sede e aquisição de máquinas, equipamentos e veículos.