Esporadicamente o café armazenado poderá vir a ser infestado por "pragas", mais especificamente por insetos, no armazém ou na tulha, principalmente quando o produto for armazenado em coco por um período maior de tempo. Os principais insetos que podem infestar o café armazenado são as traças, o besourinho Lasioderma serricone, a broca-do-café e o caruncho-das-tulhas.